罗丹明染料是荧光素的补充剂，因为它们提供更长波长的发射最大值，并为多色标记和染色提供了机会。 罗丹明的光稳定性高于荧光素和香豆素。 羧基四甲基罗丹明（TAMRA）是用于制备寡核苷酸缀合物的常见荧光团。 磺酰罗丹明101磺胺氯化物（TexasRed?）是另一种流行的寡核苷酸标记染料。 然而，TexasRed?不稳定，与其他羧基罗丹明染料（如5-TAMRA，SE）相比，其偶联产率低得多。
AAT Bioquest研发了California Red?取代了TexasRed?。 California Red?具有与TexasRed?几乎相同的光谱特性和类似的水溶性。 California Red?更稳定，并且比TexasRed?具有更高的共轭产率
图1.用于标记寡核苷酸的典型罗丹明染料的化学结构
表2.用于标记寡核苷酸的罗丹明染料
货号 | 产品名称 | 规格 | Ex (nm) | Em (nm) | EC (cm-1 M-1) | CF @260 nm | 价格 |
479 | 核酸多肽蛋白标记 | 1 mg | 583 | 603 | 100,000 | 0.456 | 1140 |
473 | 核酸多肽蛋白标记 | 5mg | 583 | 603 | 100,000 | 0.456 | 1740 |
470 | 丽丝胺碱性蕊香红 | 100 mg | 568 | 583 | 85,000 | 0.288 | 1140 |
380 | 5(6)-ROX 5(6)- | 100 mg | 568 | 591 | 85,000 | 0.301 | 5940 |
390 | 5(6)-ROX, SE 5(6)- | 25 mg | 576 | 601 | 93,000 | 0.301 | 2340 |
495 | 6-ROX 6- | 5 mg | 575 | 602 | 95,000 | 0.307 | 1740 |
494 | 6-ROX 6- | 5 mg | 575 | 602 | 95,000 | 0.307 | 1740 |
426 | 6-ROX 6- | 1 mg | 575 | 602 | 95,000 | 0.307 | 1140 |
392 | 6-ROX, SE 6- | 5 mg | 575 | 602 | 95,000 | 0.307 | 1140 |
480 | 磺基罗丹明 | 10 mg | 588 | 601 | 100,000 | 0.456 | 1140 |
370 | 5(6)-TAMRA, SE 5(6)- | 25 mg | 546 | 575 | 75,000 | 0.320 | 1140 |
423 | 5(6)-TAMRA C6 | 5 mg | 544 | 575 | 75,000 | 0.320 | 1140 |
491 | 6-TAMRA 6- | 5 mg | 547 | 573 | 75,000 | 0.335 | 1740 |
490 | 6-TAMRA 6- | 5 mg | 547 | 573 | 75,000 | 0.335 | 1740 |
425 | 6-TAMRA 6 | 5 mg | 544 | 575 | 75,000 | 0.335 | 2340 |
357 | 6- | 5 mg | 544 | 575 | 75,000 | 0.335 | 3540 |
6051 | 6-TAMRA 6- | 1 g | 546 | 578 | 75,000 | 0.335 | 5940 |
359 | 6- | 5 mg | 544 | 575 | 75,000 | 0.335 | 2340 |
419 | 6-TAMRA 6 | 1 mg | 540 | 567 | 75,000 | 0.335 | 2340 |
376 | 6-TAMRA, SE 6- | 5 mg | 547 | 573 | 78,000 | 0.335 | 1188 |
485 | Texas Red | 5 mg | 588 | 601 | 95,000 | 0.456 | 1740 |
484 | Texas Red | 5 mg | 588 | 601 | 95,000 | 0.456 | 1740 |
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