半胱氨酸蛋白酶在细胞凋亡或程序性细胞死亡中是必需的，在发育和成年生活的大多数其他阶段，并且因其在细胞中的作用而被称为“刽子手”蛋白质。中也需要一些半胱天冬酶用于淋巴细胞的成熟。细胞凋亡失败发展和自身免疫疾病的主要原因之一。半胱天冬酶也参与缺血。凋亡caspase有两种类型：引发剂和效应剂。 启动子半胱天冬酶（例如，CASP2，CASP8，CASP9和CASP10）切割效应半胱天冬酶的无活性前体形式，从而激活它们。效应子半胱天冬酶（例如，CASP3，CASP6，CASP7）依次切割细胞内的其他蛋白质底物，以触发细胞凋亡过程。该级联反应的起始受半胱天冬酶抑制剂的调节。

AAT Bioquest提供一组蓝色，绿色和红色荧光底物，用于监测caspase活性。AMC-，AFC-，R110-和ProRed - 衍生的蛋白酶底物是无色和非荧光的。通过半胱天冬酶切割阻断蛋白酶可切割的肽残基分别产生强烈的蓝色，绿色或红色荧光，其可以通过荧光仪器监测。我们专有的ProRed 衍生的半胱氨酸蛋白酶底物是用于荧光检测各种半胱天冬酶活性的最敏感的红色指示剂。通常，R110和ProRed 底物比基于AMC-，AFC-或4-硝基苯胺的底物灵敏得多。